學校于1955年開始招收研究生，1956年開始招收留學生。1960年被中央列為全國重點高等院校。1969年，學校被迫遷往雲南，輾轉十年，於1979年返京複校。1982年國務院批准該校為首批具有博士、碩士學位授予權的高校。1985年更名為北京林業大學。1996年被國家列為“211工程”首批建設的41所高校之一，2000年2月直屬教育部管理，同年6月批准試辦研究生院，12月進入“面向21世紀教育振興行動計畫”重點支持的22所高校行列。2001年1月由教育部與國家林業局共建。2003年11月被國家列為“211工程”“十五”重點建設高校。2004年5月通過教育部評估，正式成立研究生院，成為全國56所建有研究生院的高校之一。2005年被國家列為42所具有本科自主選拔錄取資格的高校之一。

學校發展得到黨和國家的重視與關懷。1965年，董必武同志為學校題詞。1984年5月，鄧小平同志親筆為學校題寫了“北京林學院”校名。2002年學校50周年校慶時李鵬同志親筆題詞“實施可持續發展戰略，為再造秀美山川培養人才”。近年來，李嵐清、薑春雲、陳慕華、賈慶林、錢其琛、何魯麗、許嘉璐、陳至立、張思卿等党和國家領導人以及周濟、周生賢等教育部和國家林業局領導同志先後多次到學校視察和指導工作。