學校立足培養素質全面的高品質人才，不斷深化教育教學改革，堅持“寬專業、厚基礎，重能力、高素質”的原則，以“人文精神、科學素養、創新能力”和諧統一為目標，構建了特色鮮明的人才培養體系。近年來，教師中有800多人次獲得國家、省部級等各類優秀教學成果獎、優秀教材獎、優秀課程獎等教學獎勵500餘項；在總共15次江蘇省舉辦的大學生數學、物理競賽中，獲獎人數10次名列第一；學校有3名博士生的學位論文入選“全國百篇優秀博士論文”。研究生就業率達100%，本科畢業生年度就業率連續八年超過99%。五十多年來，學校以嚴謹的學風和執著的科學創新精神共為國家培養輸送了10萬餘名各類高級專門人才，其中6人當選科學院、工程院院士，許多人成為高校、科研機構、企業和政府部門的領導和中堅，為學校贏得了良好的社會聲譽。

學校積極開展國內外的教育、科技交流與合作，已與美、英、法、德、日、俄等幾十個國家和地區的50多所高等院校、科研院所建立了良好的合作關係。“十五”期間邀請來校講學、交流、合作研究的國外專家學者600多人，派出留學、合作研究和訪問的教師400多人次。學校與英國考文垂大學、中英格蘭大學開展了研究生、本科層次的聯合辦學，已有五屆共300餘名學生順利赴英深造。近年來，學校每年選派數十名學生赴法、德、日、韓等國攻讀學位或短期進修。1994年，學校成立了由多家政府機構和企事業單位組成的南京理工大學董事會，董事單位在學校設立獎教金、獎學金40餘項。