同濟大學現有建築與城市規劃、土木工程、經濟與管理、電子與資訊工程、環境科學與工程、外國語、文法、材料科學與工程、機械工程、醫學、理學、交通運輸、汽車、海洋與地球科學、生命科學與技術、傳播與藝術、女子學院及軟體學院等學院，還建有繼續教育、高等技術、職業技術教育、國際文化交流、網路教育、汽車行銷及電影學院等，學校還設有經中德政府批准合作培養碩士研究生的中德學院、與法國巴黎高科大學集團合作舉辦的中法工程和管理學院等。

同濟大學已建成的校園占地面積3700多畝，分五個校區，四平路校區位于上海市四平路，滬西校區位于上海市真南路，滬北校區位于上海市共和新路，滬東校區位于上海市武東路，正在建設的嘉定校區位于安亭上海國際汽車城內。