1978年被確立為國家重點大學，1997年被列為國家“211工程”重點建設的100所大學之一，2004年成為內蒙古自治區人民政府和國家教育部共建學校。首任校長由當時的國務院副總理、自治區主席烏蘭夫兼任，科學院學部委員、著名生物學家、北京大學教授李繼侗於建校初期來校執教並擔任副校長。現任校長是自治區副主席連輯。