改校是全國中醫藥院校中首批建立博士學科點 和 博士後科研流動站的單位之一，中醫學、中藥學、中西醫結合醫學 3 個一級學科均具有博士學位授予權，並均設有博士後科研工作流動站。學校現有 6 個國家級重點學科， 10 個部局級重點學科， 3 個北京市重點學科，重點學科建設在全國中醫藥院校中保持領先地位。學校現有教育部重點實驗室１個，北京市重點實驗室 2 個，國家中醫藥管理局重點研究室 2 個。學校是國家理科人才培養基地、國家生命科學與技術人才培養基地，建設有“教育部中藥制藥與新藥開發關鍵技術工程研究中心”、“教育部高等學校中醫藥現代化網上合作研究中心”，並與北京師範大學共建“國家大學科技園”。