學校教學、醫療和科研力量雄厚。現有高級專業技術職務人員776名，中科院院士2名，工程院院士2名，國務院學位委員會學科評議組成員3名，博士生導師134名，碩士生導師377名，外籍客座教授104名，有245名專家享受政府特殊津貼，28人在國際學術機構擔任理事以上職務。著名肝膽外科專家、中科院院士吳孟超教授，1996年被中央軍委授予“ 模範醫學專家”稱號。長海、長征兩所附屬醫院於1993年首批被評定為三級甲等醫院，東方肝膽外科醫院於1996年被評為三級甲等專科醫院。學校現有生理學、遺傳學、免疫學、航空航太與航海醫學、內科學（消化系病）、影像醫學與核醫學、外科學（普外、骨外、胸心外、燒傷）、中西醫結合臨床、藥理學等12個國家級重點學科；燒傷醫學中心、中醫內科中心、神經外科中心、腎臟病中心、急診醫學中心、血液病中心、消化內科中心、泌尿外科中心、醫學免疫診斷中心、護理教育中心等10個全軍醫學專科中心；胸心外科研究所、骨科研究所、血管外科研究所、中西藥研究所、肝膽外科研究所等5個全軍醫學研究所；醫學肝膽腫瘤、免疫與基因治療、神經生理、藥物化學、醫學微生物、臨床免疫、心臟外科、消化內科、細胞生物信號轉導等9個軍隊醫學重點專業實驗室；肝膽外科、脊柱外科、燒傷外科、神經外科、胸心外科等5個上海市醫學領先專業重點學科。“九五”期間，共獲准省部級以上科研專案639項，經費總額11338.9萬元。其中，獲准國家自然科學基金各類專案301項，居全國醫科院校第一、各類高校第十二位。曹雪濤教授作為首席科學家，獲國家重點基礎研究發展規劃（“973”專案）資助。1978 年以來，共獲軍隊、省市、部委級以上科技成果1574項，在全國醫科類院校中名列前茅。