學校高度重視科學研究和對外學術交流。近年來，在基礎醫學、臨床醫學、軍事醫學、生物醫學工程等方面，取得了一大批科研成果，獲得各類科技成果獎1200餘項。“九五”以來，學校獲得國家自然科學獎、發明獎、科技進步獎數量居全國醫科院校首位。學校在國家源期刊雜誌發表論文及獲得國家自然科學基金數量也在全國同類院校名列前茅。學校對外學術交流日益增多。1978年以來，學校共派出3500多人次到60餘個國家和地區的教學、醫療或研究機構留學和學術交流；接待近90個國家和地區的10000多名專家學者來校訪問，其中9位是生理學或醫學諾貝爾獎獲得者。目前學校已與美、英、日、法、德、澳等數十個國家和地區的學術機構建立了穩定的學術交流管道和合作關係。