“十五”以來，該校科技成果豐碩，國家三大科技計畫專案數位居涉海單位之首：“863”計畫項目總經費2億元，其中2006年學校“十一五”863計畫項目合同總經費1億元 ；國家自然科學基金每年平均2000萬，列全國高校約第25位；主持3項國家重大基礎發展規劃（973）專案，占已立項涉海專案的30％，主持專案數列全國高校第9位。“十五”以來，該校獲國家自然科學二等獎1項、國家科技進步二等獎2項、山東省科學技術最高獎1項、省部級一等獎19項、省部級二等獎35項、人文社會學科省部級以上獎勵24項。被SCI、EI、ISTP等收錄論文2864篇，人均數列部屬高校前列；申請專利767項，授權專利304項。

2006年4月，學校“十五”“211工程”建設順利通過專家驗收。2007年1月，學校獲得教育部、國家海洋局、山東省、青島市“985工程”二期共建支援。

21世紀是海洋世紀。學校的發展目標是：到2010年，基本實現高水準特色大學建設目標，構建起研究型大學的框架；到2025年或更長一段時間，建設成為特色顯著的綜合性、研究型高水準大學。