學校師資力量雄厚，薈萃著眾多知名的藥學專家、教授。現有教職工1400餘人，專任教師610餘人，其中具有高級職稱的占40%，具有碩士及以上學位的占45%，有科學院院士和工程院院士2人，有博士生導師60人，碩士生導師122人，51名教師享受國家政府特殊津貼。有70餘人次分別擔任了國務院學位委員會學科評議組成員、國家自然科學獎評委、國家科技進步獎評委、藥典委員會委員、國際和國內學術團體的領導、國家新藥評審委員會委員以及全國性、國際性期刊雜誌的正副主編，在國內外享有較高聲譽。

學校下設藥學院、中藥學院、生命科學和技術學院、國際醫藥商學院、成人教育學院、高等職業技術學院、基礎部、社會科學部、體育部、外語系等10個院部系。有23個博士點，其中藥物化學、生藥學、藥劑學3個學科為國家重點學科點，現代中藥學與天然藥物學學科是江蘇省11個重中之重學科之一；設有藥學博士後流動站，14個學科專業可招收博士後研究人員；有26個碩士點；設置15個本科專業以及“國家基礎科學研究與教學人才培養基地基礎藥學專業點”和“國家生命科學與技術人才培養基地”。學校是教育部指定接受藥學學科外國來華留學生、進修生和高級訪問學者的唯一基地，也是教育部批准可以接受華僑、港澳地區及臺灣省學生的定點院校之一。學校的高等職業技術學院是教育部確定的全國首批15所示範性職業技術學院建設單位之一。
2002年“國家基礎科學研究與教學人才培養基地基礎藥學專業點”被教育部評為“優秀基地”。生藥學被評為2003年度國家精品課程。2003年學校的藥學、制藥工程、中藥學3個本科專業被評為江蘇省品牌專業建設點，藥物製劑、生物工程2個本科專業被評為江蘇省特色專業建設點。